第78回選抜高校野球大会（甲子園）
2006年(平成18年)3月23日～4月4日
| 4(兵 庫) | 神港学園 |  |
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| 3(山 口) | 南陽工 |  |
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| 2(徳 島) | 小松島 |  |
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| 初(千 葉) | 成 田 |  |
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| 7(和歌山) | 智弁和歌山 | |
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| 初(佐 賀) | 伊万里商 | |
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| 初(岩 手) | 一関学院 |  |
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| 初(岐 阜) | 岐阜城北 |  |
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| 11(神奈川) | 横 浜 |  |
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| 初(大 阪) | 履正社 | |
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| 初(沖 縄) | 八重山商工 |  |
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| 3(富 山) | 高岡商 |  |
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| 3(青 森) | 光星学院 |  |
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| 8(岡 山) | 関 西 |  |
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| 18(東 京) | 早稲田実 |  |
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| 4(北海道) | 北海道栄 | |
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| 初(滋 賀) | 北大津 |  |
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| 2(北海道) | 旭川実 |  |
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| 初(新 潟) | 日本文理 | |
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| 2(群 馬) | 高崎商 |  |
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| 8(岡 山) | 岡山東商 |  |
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| 初(長 崎) | 清 峰 |  |
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| 7(神奈川) | 東海大相模 | |
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| 6(京 都) | 京都外大西 | |
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| 19(大 阪) | PL学園 |  |
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| 初(栃 木) | 真岡工 | |
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| 3(石 川) | 金沢桜丘 |  |
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| 初(愛 知) | 愛知啓成 |  |
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| 初(愛 媛) | 今治北 |  |
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| 2(宮 崎) | 延岡学園 |  |
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| 5(秋 田) | 秋田商 |  |
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| 2(東 京) | 東海大菅生 |  |
| 一 | 二 | 三 | 四 | 五 | 六 | 七 | 八 | 九 | 計 | |
| 横 浜 | 0 | 3 | 1 | 2 | 0 | 9 | 0 | 2 | 4 | 21 |
| 清 峰 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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 同年の夏の大会へ |
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