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第71回選抜高等学校野球大会（甲子園）
1999年(平成11年)3月25日～4月4日
| 2(長 野) | 東海大三 |  |
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| 4(島 根) | 浜 田 |  |
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| 2(沖 縄) | 沖縄尚学 |  |
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| 5(滋 賀) | 比叡山 |  |
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| 2(山 梨) | 市 川 |  |
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| 2(徳 島) | 鳴門工 |  |
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| 7(北海道) | 駒大岩見沢 |  |
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| 4(兵 庫) | 神戸弘陵 |  |
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| 14(宮 城) | 東 北 |  |
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| 2(岡 山) | 玉野光南 |  |
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| 9(神奈川) | 横 浜 |  |
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| 18(大 阪) | PL学園 |  |
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| 2(長 崎) | 長崎日大 |  |
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| 初(東 京) | 駒 大 |  |
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| 23(愛 知) | 東 邦 |  |
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| 33(京 都) | 平 安 | |
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| 14(福 井) | 福井商 | |
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| 14(東 京) | 日大三 | |
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| 5(山 口) | 岩 国 | |
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| 2(茨 城) | 水戸商 |  |
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| 8(高 知) | 明徳義塾 |  |
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| 3(兵 庫) | 滝川二 |  |
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| 2(三 重) | 海 星 |  |
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| 初(福 岡) | 九産大九州 |  |
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| 初(京 都) | 峰 山 | |
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| 3(宮 崎) | 日南学園 | |
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| 初(千 葉) | 柏 陵 | |
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| 14(静 岡) | 静 岡 |  |
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| 3(秋 田) | 金足農 |  |
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| 7(愛 媛) | 今治西 |  |
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| 初(群 馬) | 高崎商 |  |
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| 2(奈 良) | 高 田 | |
| 一 | 二 | 三 | 四 | 五 | 六 | 七 | 八 | 九 | 計 | |
| 水戸商 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 |
| 沖縄尚学 | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 2 | 0 | X | 7 |
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